Le juge a aussi décidé de demander la mise sur pied d'une commission médicale désignée par le ministère de la Santé pour faire un rapport sur l'état de santé de cette figure de la société civile burundaise. Une décision contradictoire et qui montre la partialité de la justice burundaise, selon la défense de Pierre-Claver Mbonimpa. Au point que les avocats ont décidé de ne pas faire appel.